Pesantren Ngruki
Beberapa pesantren lain tidak terkait langsung dengan Ngruki, tetapi mempunyai irisan perjuangan dengan Abu Bakar Ba’asyir yaitu Nizam Islam atau Khilafah Islamiyah
Ngruki mungkin mengajarkan cara pandang yang radikal tentang Islam, tetapi tidak lalu semuanya jadi teroris